一篇临床医学论文的基本结构一般包括论题、摘要、引言、资料与方法、结果、讨论。下面分别介绍如下：
选择论题：
撰写医学论文首先要选好论题(即篇名或题目)."名不正则言不顺",如选题不恰当就容易使写作不顺心或造成失败,即使勉强成文,也往往文不对题或名不副实.一个令人满意的论题应该是:文题相符,主题突出,鲜明确切,概括全文,反映论点.一般认为选择论题的过程,实际.上是在掌握第一手资料(直接材料)的基础上,进行有关文献查阅观察分析、综合归纳和逻辑思维的过程.作者可在原始创作的意图上,先拟出几个预选题目,然后进行对比分析、综合判断和反复思考及查阅有关文献而最后选择一个最佳论题.对选定的论题要能体现理论上有新的见解,在学术上有所创见,在技术上有所创新.如能按这样的目的、步骤、方法进行认真严肃地选择,深思熟虑地推敲,一般都能选出较满意的题目来.
摘要：
摘要是论文的缩影，是全文的概括和浓缩，是论文内容不加评论和注释的简短陈述，是一篇有数据有结论的短文。他可以使读者一目了然，从而大大节约阅读时间，能在短时间内让读者决定是否值得进一步详读全文。目前，医学论文的摘要大多采用结构式摘要的格式，即包括目的、方法、结果、结论四个要素。摘要的字数不宜超过个实词。除了实在无变通办法可用以外，不用图、表、化学结构式和非公知公用的符号和术语。縮略语、略称、代号，在首次出现处必须加以说明。一般比较重要的论文都有摘要，内容较简单或较短的论文也可没有摘要。
引言：
引言部分主要介绍与研究主题相关的背景资料和已有研究成果。引言应该简要回顾前人的研究成果，并指出当下的研究缺口或存在的问题，从而确定研究的目的和意义。
资料与方法：
资料中应包括:①病例来源:观察对象来自某年、某月，是住院还是门诊患者，分组时多少例，完成疗程的多少例:②一般资料:包括年龄、性别、病程、就诊时间、伴发疾病等③诊断标准:为了方便别人参考，诊断标准为国际或国内标准的应给出参考文献④排除标准:指出哪些情况不在本次研究之列:⑤分组情况:要随机分组，不但更介绍疗组的情况，对照组的年龄、性别等也要说清楚，两组要具有可比性⑥统计学方法:对不同的数据资料要选择正涌的统计学方法。
方法中包括:①治疗方法，如观察药物治疗某种疾病时，应介绍药物剂量、剂型、服用方法疗程:②实验室检查及特殊检查，包括些常规检查如血尿便常规，线朐透、心电图等，特殊检查包括脑电图、CT.核磁共振等:③疗效判断标准④随访情况，包括随访人数及失访人数、随访结果、有无误诊等⑤实验器材要写清名称、规格、性能，以便别人能够重复。
结果：
结果部分主要呈现研究的主要发现。通过表格、图表或文字描述，作者可以清晰地展示实验观察到的数据和统计分析结果。结果应该与引言中的研究目的相一致，并以客观和准确的方式呈现。
讨论：
是论文所要报道的中心内容，是将研究结果从感性认识提高到理性认识的阶段。它应该包括:①对所得结果进行补充说明或解释:重点说明该项研究的创新性、先进性②对结果进行分析探讨，对可能原因、机制提出见解，并阐明观点:③将结果与当前国内外研究结论进行比较，提出新的见解，并对其理论和实践意义作出评价:④提出在调查研究过程中的经验体会⑤指出该结果的可能误差，以及教训。此部分的写作要求:①大量阅读有关文献，充分地了解本研究的历史、发展及现状:②不罗列文献，详略得当，重点突出。着重